ASP.NET Core 应用程序的自定义设置可以存储在不同的位置，以下是几种常用的解决方法。

1. appsettings.json 文件：可以将设置存储在应用程序根目录下的 appsettings.json 文件中。可以使用以下代码示例读取设置：

var configuration = new ConfigurationBuilder()
    .SetBasePath(Directory.GetCurrentDirectory())
    .AddJsonFile("appsettings.json")
    .Build();

var settingValue = configuration["SettingKey"];

2. 环境变量：可以将设置存储在操作系统的环境变量中。可以使用以下代码示例读取设置：

var settingValue = Environment.GetEnvironmentVariable("SettingKey");

3. 命令行参数：可以通过命令行参数传递设置。可以使用以下代码示例读取设置：

var commandLineArgs = Environment.GetCommandLineArgs();
var settingValue = commandLineArgs.FirstOrDefault(arg => arg.StartsWith("--SettingKey="))?.Split('=')[1];

4. 自定义配置提供程序：可以实现自定义的配置提供程序来存储和读取设置。以下是一个示例：

public class CustomConfigurationProvider : ConfigurationProvider
{
    public override void Load()
    {
        // 从自定义存储位置加载设置
        var settingValue = LoadSettingFromCustomStore("SettingKey");
        Data.Add("SettingKey", settingValue);
    }

    private string LoadSettingFromCustomStore(string key)
    {
        // 从自定义存储位置加载指定键的设置值
        // 实现自己的逻辑

        return settingValue;
    }
}

public class CustomConfigurationSource : IConfigurationSource
{
    public IConfigurationProvider Build(IConfigurationBuilder builder)
    {
        return new CustomConfigurationProvider();
    }
}

然后，可以在 Startup.cs 中使用自定义配置提供程序：

public class Startup
{
    public IConfiguration Configuration { get; }

    public Startup(IConfiguration configuration)
    {
        Configuration = configuration ?? throw new ArgumentNullException(nameof(configuration));
    }

    public void ConfigureServices(IServiceCollection services)
    {
        // 注册自定义配置提供程序
        services.AddSingleton(new CustomConfigurationSource());
        services.AddSingleton(provider => new ConfigurationRoot(new List
        {
            provider.GetService().Build(provider)
        }));
    }
}

以上是几种常见的解决方法，根据具体的需求和应用场景，可以选择适合的方式存储和读取自定义设置。