要在ValidationSummary中显示CustomValidator的ErrorMessage，而不在其他地方显示，可以使用以下方法：

1. 在ASP.NET页面上添加一个ValidationSummary控件，用于显示所有验证错误消息。

2. 在CustomValidator控件上设置Display属性为None，以便在页面上不显示错误消息。

3. 在CustomValidator的ServerValidate事件中编写验证逻辑。如果验证失败，将ErrorMessage设置为错误消息，并将IsValid属性设置为false。

protected void CustomValidator1_ServerValidate(object source, ServerValidateEventArgs args)
{
   // 验证逻辑
   if (args.Value == "invalid")
   {
      CustomValidator1.ErrorMessage = "请输入有效的值";
      args.IsValid = false;
   }
   else
   {
      args.IsValid = true;
   }
}

4. 在页面上的其他位置上添加一个Label控件，用于显示CustomValidator的ErrorMessage。

5. 在页面的Code-behind文件中，根据CustomValidator的IsValid属性的值，决定是否显示Label控件，并将ErrorMessage赋值给Label的Text属性。

protected void Button1_Click(object sender, EventArgs e)
{
   if (Page.IsValid)
   {
      // 验证通过
   }
   else
   {
      // 验证失败
      Label1.Visible = true;
      Label1.Text = CustomValidator1.ErrorMessage;
   }
}

通过以上步骤，CustomValidator的ErrorMessage将只会在ValidationSummary中显示，而不会在其他地方显示。如果页面上有多个CustomValidator控件，可以根据需要重复上述步骤。