这种情况一般是因为ATMEGA和Linux使用的CRC32算法不同所致。为了解决这个问题，应该在所有计算CRC32的设备上使用相同的算法。

以下是一个C语言的示例代码，可用于在ATMEGA和Linux上计算相同的CRC32值：

#include 
#include 

#define POLYNOMIAL 0xEDB88320

uint32_t calculate_crc32(uint8_t *data, size_t size)
{
    uint32_t crc = 0xFFFFFFFF;
    for (size_t i = 0; i < size; i++)
    {
        crc ^= data[i];
        for (size_t j = 0; j < 8; j++)
        {
            if (crc & 0x00000001)
            {
                crc = (crc >> 1) ^ POLYNOMIAL;
            }
            else
            {
                crc = crc >> 1;
            }
        }
    }
    return ~crc;
}

int main()
{
    uint8_t data[] = {0x01, 0x02, 0x03, 0x04};
    size_t size = sizeof(data)/sizeof(data[0]);
    uint32_t crc32 = calculate_crc32(data, size);

    printf("CRC32 value: %08X\n", crc32);

    return 0;
}

请注意，此示例是使用CRC32的标准实现（使用0xEDB88320作为多项式）。