对于该问题，可以采用以下步骤进行解决：

1. 首先在Atmel Studio中打开工程，并创建新的C++源文件。

2. 然后定义所需的变量和管脚。例如：

   #include 
   #define PIN_TC_CAPTURE_0 PB05
   #define TC_CAPTURE TC4
   

3. 接下来，设置管脚和捕获模式。对于捕捉模式，可以选择上升沿、下降沿或两者都捕获。例如：

   gpio_set_pin_function(PIN_TC_CAPTURE_0, PINMUX_PB05E_TC4_WO0);
   tc_capture_set_capture_mode(&TC_CAPTURE, TC_CAPTURE_CHANNEL_0, TC_CAPTURE_MODE_FALLING);
   

4. 然后设置计时器和捕获通道，并启用捕获功能。例如：

   struct tc_config config_tc_capture;
   tc_get_config_defaults(&config_tc_capture);
   config_tc_capture.counter_size = TC_COUNTER_SIZE_16BIT;
   config_tc_capture.clock_source = GCLK_GENERATOR_0;
   config_tc_capture.clock_prescaler = TC_CLOCK_PRESCALER_DIV1;
   tc_init(&TC_CAPTURE, &config_tc_capture);
   
   tc_capture_enable(&TC_CAPTURE, TC_CAPTURE_CHANNEL_0);
   

5. 最后，在main函数中，可以使用以下代码以读取捕获到的脉冲宽度：

   uint16_t pulse_width = tc_capture_get_capture_value(&TC_CAPTURE, TC_CAPTURE_CHANNEL_0);
   

使用上述方法，就可以在Atmel SAM D51上精确捕获脉冲宽度。