在AVR中，主函数（main）和中断服务程序（ISR）之间的干扰可能会导致程序的不正常运行。这种干扰可能发生在ISR正在执行时，主函数也在执行，或者主函数正在执行时，ISR也在执行。为了解决这个问题，可以采取以下几种方法：

1. 禁用中断：在主函数中，可以使用cli()函数禁用中断，这样可以确保在主函数执行期间不会发生ISR的干扰。然后，在主函数执行完毕后，使用sei()函数重新启用中断。

int main() {
  cli(); // 禁用中断

  // 主函数代码

  sei(); // 启用中断

  while(1) {
    // 主循环代码
  }

  return 0;
}

2. 使用标志位：可以定义一个全局变量作为标志位，在ISR中设置标志位，在主函数中检查标志位的状态。这样可以根据标志位的值来决定是否执行特定的代码。

volatile int isrFlag = 0;

ISR(TIMER1_COMPA_vect) {
  // ISR代码

  isrFlag = 1; // 设置标志位
}

int main() {
  // 主函数代码

  while(1) {
    if(isrFlag) {
      // 处理ISR中断的代码
      isrFlag = 0; // 清除标志位
    }
    // 主循环代码
  }

  return 0;
}

3. 使用缓冲区：如果ISR会修改主函数中的变量，可以使用缓冲区将ISR中的数据保存下来，然后在主函数中使用缓冲区中的数据。这样可以避免ISR对主函数中的变量的干扰。

volatile int isrBuffer = 0;

ISR(TIMER1_COMPA_vect) {
  // ISR代码

  isrBuffer = // 将ISR中的数据保存到缓冲区
}

int main() {
  // 主函数代码

  while(1) {
    int data = isrBuffer; // 使用缓冲区中的数据

    // 主循环代码
  }

  return 0;
}

这些解决方法可以根据具体情况选择使用。重要的是要确保主函数和ISR之间的干扰不会导致程序的不正常运行。