在AWS CloudFormation模板中删除AWS API网关的代理可以通过以下示例代码实现：

Resources:
  MyApi:
    Type: AWS::Serverless::Api
    Properties:
      StageName: prod
      DefinitionBody:
        swagger: "2.0"
        info:
          title: "My API"
          version: "1.0"
        paths:
          /path1:
            get:
              responses:
                '200':
                  description: 'OK'
          /path2:
            get:
              responses:
                '200':
                  description: 'OK'

在这个示例中，我们使用AWS Serverless Application Model (SAM) 定义了一个名为MyApi的AWS API网关。我们没有指定任何代理集成，所以它将不会代理任何请求。

请注意，这只是一个示例，你可能需要根据你的实际情况进行调整和修改。