在AWS CloudFormation中，如果在模板中使用了分配的VPC创建RDS资源时遇到问题，可以尝试以下解决方法：

1. 确保VPC存在：在CloudFormation模板中使用的VPC必须存在，并且具有正确的名称或ID。可以通过AWS管理控制台或AWS CLI确认VPC的存在。

2. 检查VPC子网：如果使用了VPC子网创建RDS资源，确保子网存在并具有正确的名称或ID。可以通过AWS管理控制台或AWS CLI确认子网的存在。

3. 检查安全组：如果使用了VPC安全组，确保安全组存在并具有正确的名称或ID。可以通过AWS管理控制台或AWS CLI确认安全组的存在。

下面是一个使用AWS CloudFormation创建RDS资源的示例模板：

{
  "Resources": {
    "MyDBInstance": {
      "Type": "AWS::RDS::DBInstance",
      "Properties": {
        "DBInstanceIdentifier": "my-db-instance",
        "AllocatedStorage": "10",
        "DBInstanceClass": "db.t2.micro",
        "Engine": "MySQL",
        "EngineVersion": "5.7",
        "MasterUsername": "admin",
        "MasterUserPassword": "password",
        "VPCSecurityGroups": [
          {
            "Ref": "MySecurityGroup"
          }
        ],
        "DBSubnetGroupName": {
          "Ref": "MySubnetGroup"
        }
      }
    },
    "MySecurityGroup": {
      "Type": "AWS::EC2::SecurityGroup",
      "Properties": {
        "GroupDescription": "RDS security group",
        "VpcId": {
          "Ref": "MyVPC"
        }
      }
    },
    "MySubnetGroup": {
      "Type": "AWS::RDS::DBSubnetGroup",
      "Properties": {
        "DBSubnetGroupDescription": "Subnet group for RDS",
        "SubnetIds": [
          {
            "Ref": "MySubnet"
          }
        ]
      }
    },
    "MySubnet": {
      "Type": "AWS::EC2::Subnet",
      "Properties": {
        "VpcId": {
          "Ref": "MyVPC"
        },
        "CidrBlock": "10.0.0.0/24"
      }
    },
    "MyVPC": {
      "Type": "AWS::EC2::VPC",
      "Properties": {
        "CidrBlock": "10.0.0.0/16"
      }
    }
  }
}

上述示例模板创建了一个VPC、子网、安全组和RDS实例。可以根据需要进行修改，确保VPC、子网和安全组的引用正确，并且具有正确的名称或ID。