在AWS Elastic Beanstalk中使用ebextensions来配置httpd.conf时，可能会遇到Apache日志打印两次的问题。这可能是由于在ebextensions中重复定义了日志格式的原因。以下是解决该问题的代码示例：

1. 创建一个名为.ebextensions的文件夹，并在其中创建一个名为httpd.config的文件。

2. 在httpd.config文件中，使用以下代码来创建自定义的日志格式并应用它：

files:
  "/etc/httpd/conf.d/my_custom_log.conf":
    mode: "000644"
    owner: root
    group: root
    content: |
      LogFormat "%h %l %u %t \"%r\" %>s %b" my_custom_format
      CustomLog "/var/log/httpd/my_custom_log" my_custom_format

在上面的代码中，我们定义了一个名为my_custom_format的自定义日志格式，并将其应用于/var/log/httpd/my_custom_log路径。您可以根据自己的需求更改日志格式和路径。

3. 重新部署您的应用程序，以便应用新的配置。

通过以上步骤，您应该能够成功创建并应用自定义的Apache日志格式，从而避免日志打印两次的问题。请确保在ebextensions中不重复定义日志格式，以避免出现冲突。