在AWS EKS上使用Rancher时，升级Kubernetes版本后可能会导致节点消失的问题。下面是一个可能的解决方法，包含一些代码示例。

1. 确认Rancher是否与EKS集群正确连接。您可以使用以下命令检查连接状态：

kubectl get nodes

如果显示正常的节点列表，则说明Rancher与EKS集群连接正常。

2. 检查EKS集群的节点是否处于正常状态。您可以使用以下命令检查节点状态：

kubectl get nodes

如果节点状态为NotReady，则可能是由于Kubernetes版本升级引起的。您可以尝试重新启动节点来解决此问题：

kubectl drain  --ignore-daemonsets --delete-local-data
kubectl delete node 

然后，等待节点重新注册到集群中。

3. 检查Rancher的节点管理器是否正确配置。在Rancher中，您需要正确配置节点管理器以与EKS集群进行交互。确保节点管理器的配置文件中包含正确的集群访问凭证。

apiVersion: v1
kind: Config
clusters:
- name: eks-cluster
  cluster:
    certificate-authority-data: 
    server: 
contexts:
- name: eks-context
  context:
    cluster: eks-cluster
    user: eks-user
current-context: eks-context
users:
- name: eks-user
  user:
    token: 

4. 检查Rancher的节点管理器是否使用正确的API服务器URL。您可以在节点管理器的配置文件中指定正确的API服务器URL：

apiVersion: v1
kind: Node
metadata:
  name: eks-node
spec:
  kubeletConfig:
    clusterDomain: 
    clusterDNS:
    - 
    server: 

确保 是正确的EKS集群API服务器URL。

5. 如果使用了自定义的Kubernetes配置文件，请确保所有配置正确。可以通过运行以下命令检查配置文件是否有误：

kubectl config view --minify

以上是一些可能的解决方法，可以帮助您解决在AWS EKS上使用Rancher时升级Kubernetes版本后节点消失的问题。请根据您的具体情况选择适当的解决方案。