在AWS AppSync中使用GraphQL进行多对多关系的建模可以通过使用连接表来实现。连接表是一个中间表，用于存储两个实体之间的关系。

下面是一个示例，其中有两个实体 User 和 Group，它们之间有多对多关系。假设一个用户可以加入多个组，一个组也可以有多个用户。

首先，定义 User 和 Group 的数据模型：

type User {
  id: ID!
  name: String!
  groups: [GroupUser] @connection(name: "UserGroups")
}

type Group {
  id: ID!
  name: String!
  members: [GroupUser] @connection(name: "GroupMembers")
}

type GroupUser @connection(name: "UserGroups") {
  id: ID!
  user: User!
  group: Group!
  createdAt: String
}

在上面的示例中，我们使用 @connection 指令来定义连接表，它指定了连接表的名称。User 对象有一个名为 groups 的字段，它通过连接表 GroupUser 与 Group 对象相关联。同样，Group 对象有一个名为 members 的字段，它也通过连接表 GroupUser 与 User 对象相关联。

接下来，我们可以使用 AWS Amplify CLI 来生成模型和 GraphQL API：

amplify add api

选择 GraphQL 作为 API 类型，并按照提示完成配置。

然后，运行以下命令来将模型推送到 AWS AppSync：

amplify push

完成以上步骤后，你可以使用 AWS Amplify 或其他 GraphQL 客户端来查询和修改 User 和 Group 对象的关系。

以下是一个使用 AWS Amplify JavaScript 客户端的示例代码，用于查询某个用户所属的所有组：

import Amplify, { API, graphqlOperation } from 'aws-amplify';
import { getUser } from './graphql/queries';

Amplify.configure({
  // 配置你的 AWS Amplify
});

const fetchUserGroups = async (userId) => {
  try {
    const user = await API.graphql(graphqlOperation(getUser, { id: userId }));
    console.log(user.data.getUser.groups);
  } catch (error) {
    console.log(error);
  }
};

fetchUserGroups('user-id');

上述代码使用 graphqlOperation 函数来构建查询，并通过 API.graphql 方法发送请求。查询结果中的 user.data.getUser.groups 将返回与该用户相关的所有组。

这只是一个简单的示例，你可以根据具体需求进行更复杂的查询和操作。