要实现AWS S3生命周期规则，仅删除根目录中的.JSON文件，您可以按照以下步骤进行操作:

步骤1: 创建一个JSON文件，命名为lifecycle.json，并在其中添加以下内容：

{
  "Rules": [
    {
      "ID": "DeleteJSONFiles",
      "Status": "Enabled",
      "Filter": {
        "Prefix": ""
      },
      "Expiration": {
        "Days": 30
      },
      "Transitions": [],
      "NoncurrentVersionTransitions": [],
      "NoncurrentVersionExpiration": {},
      "AbortIncompleteMultipartUpload": {
        "DaysAfterInitiation": 7
      },
      "TagFilters": [
        {
          "Key": "extension",
          "Value": "json"
        }
      ]
    }
  ]
}

此规则仅指定删除根目录（prefix为空）下的.JSON文件，并设置了过期时间为30天。

步骤2: 使用AWS CLI或AWS SDK将此规则应用到您的S3存储桶上。以下是使用AWS CLI的示例命令：

aws s3api put-bucket-lifecycle-configuration --bucket your-bucket-name --lifecycle-configuration file://lifecycle.json

请确保将"your-bucket-name"替换为您的S3存储桶的名称。

步骤3: 执行命令后，生命周期规则将应用到您的S3存储桶上，S3将自动按照规则删除根目录中的.JSON文件。

请注意，如果您的存储桶中有大量的对象，应用规则可能需要一些时间来完成。