遇到“AWS跨账号S3 PutObject被AWS托管密钥加密的访问被拒绝问题”的解决方法主要涉及以下几个步骤：

1. 确保IAM角色和策略设置正确：首先，确保两个AWS账号之间已经正确建立了跨账号访问的信任关系，并且在源账号中创建了包含sts:AssumeRole权限的IAM角色。然后，为该角色关联适当的策略，以允许访问目标账号的S3存储桶。

以下是一个示例的IAM策略，假设源账号中的IAM角色名为CrossAccountRole，目标账号中的S3存储桶名为destination-bucket：

{
  "Version": "2012-10-17",
  "Statement": [
    {
      "Sid": "AllowPutObject",
      "Effect": "Allow",
      "Action": [
        "s3:PutObject"
      ],
      "Resource": "arn:aws:s3:::destination-bucket/*"
    }
  ]
}

2. 检查AWS密钥管理服务（AWS KMS）：确保目标账号中使用的S3存储桶启用了AWS KMS加密，并且加密使用的密钥正确配置。如果加密使用的是AWS托管密钥（AWS Managed Key），则确保源账号中的IAM角色有足够的权限来使用该密钥。

3. 确保正确配置权限：在源账号的IAM角色策略中，需要为AWS KMS提供访问权限。例如，以下是一个允许IAM角色访问AWS KMS的策略示例：

{
  "Version": "2012-10-17",
  "Statement": [
    {
      "Sid": "AllowKMSAccess",
      "Effect": "Allow",
      "Action": [
        "kms:Encrypt",
        "kms:Decrypt",
        "kms:GenerateDataKey*"
      ],
      "Resource": "*"
    }
  ]
}

4. 确保正确配置S3存储桶策略：在目标账号的S3存储桶策略中，需要允许源账号的IAM角色访问该存储桶。以下是一个示例策略：

{
  "Version": "2012-10-17",
  "Statement": [
    {
      "Sid": "AllowCrossAccountAccess",
      "Effect": "Allow",
      "Principal": {
        "AWS": "arn:aws:iam::SOURCE_ACCOUNT_ID:role/CrossAccountRole"
      },
      "Action": [
        "s3:PutObject"
      ],
      "Resource": "arn:aws:s3:::destination-bucket/*"
    }
  ]
}

确保将SOURCE_ACCOUNT_ID替换为源账号的ID和角色名。

以上是解决“AWS跨账号S3 PutObject被AWS托管密钥加密的访问被拒绝问题”的一般步骤和示例代码。具体解决方法可能因您的环境和配置而有所不同，您需要根据实际情况进行适当调整。如果问题仍然存在，建议参考AWS文档或向AWS支持寻求进一步帮助。