要正确设置Babel-CLI的配置值，可以按照以下步骤操作：

1. 首先，确保已经全局安装了Babel-CLI。可以使用以下命令进行安装：

npm install -g @babel/cli

2. 在项目的根目录下创建一个.babelrc文件。.babelrc文件用于存放Babel的配置信息。

3. 打开.babelrc文件，并设置所需的配置值。以下是一个示例的.babelrc文件：

{
  "presets": ["@babel/preset-env"],
  "plugins": ["@babel/plugin-transform-runtime"]
}

在上述示例中，presets用于设置Babel的预设，plugins用于设置Babel的插件。

4. 可以根据需要修改或添加其他配置选项。

5. 接下来，可以使用Babel-CLI命令来转换代码。以下是一个示例命令：

babel src --out-dir dist

在上述示例中，src是源代码目录，dist是输出目录。

这样，Babel-CLI将会根据.babelrc文件中的配置值来转换源代码，并将转换后的代码输出到指定的目录中。

请注意，上述示例中使用的是Babel 7版本的配置方式。如果使用的是Babel 6版本，配置方式会有所不同。在Babel 6中，可以将配置信息直接放在package.json文件的babel字段中。