要将FLV文件转换为MP4文件并保持PTS一致，可以使用FFmpeg库来实现。下面是一个使用Python调用FFmpeg库进行转换的示例代码：

import subprocess

def convert_flv_to_mp4(input_file, output_file):
    # 使用FFmpeg命令将FLV文件转换为MP4文件并保持PTS一致
    command = f'ffmpeg -i {input_file} -c:v copy -c:a copy -avoid_negative_ts 1 {output_file}'
    
    # 执行FFmpeg命令
    subprocess.call(command, shell=True)

# 输入FLV文件路径和输出MP4文件路径
input_file = 'input.flv'
output_file = 'output.mp4'

# 调用函数进行转换
convert_flv_to_mp4(input_file, output_file)

在上述示例中，我们使用了subprocess模块来调用FFmpeg命令行工具。-c:v copy和-c:a copy参数用于复制FLV文件中的视频和音频流到MP4文件中，以保持编码格式不变。-avoid_negative_ts 1参数用于保持PTS一致。

请确保已经安装了FFmpeg，并将其添加到系统的环境变量中，以便能够在命令行中执行FFmpeg命令。

以上示例代码仅供参考，实际使用时可能需要根据具体情况进行适当修改。