保存用户从谜题中的输入到数据库的最佳方式通常涉及以下几个步骤：

1. 创建数据库表格：首先，需要创建一个数据库表格来存储用户的输入。表格的结构应该包含所需的字段，例如用户ID、问题ID、用户输入的答案等。

2. 连接到数据库：接下来，需要通过适当的方式连接到数据库。这可以通过使用数据库的特定库（如MySQL、SQLite、PostgreSQL等）的API或框架来完成。

3. 接收用户输入：在网页或应用程序的前端，需要设计一个适当的界面来接收用户的输入。可以使用HTML表单元素（如文本框、下拉菜单等）来收集用户答案。

4. 处理用户输入：在服务器端，使用适当的后端编程语言（如Python、PHP、Java等）来处理用户的输入。根据需求，可以对用户输入进行验证、清理或转换。

5. 将用户输入保存到数据库：通过执行适当的SQL语句，将用户输入保存到数据库中。以下是一个使用Python和MySQL数据库的示例代码：

import mysql.connector

# 连接到MySQL数据库
mydb = mysql.connector.connect(
  host="localhost",
  user="yourusername",
  password="yourpassword",
  database="yourdatabase"
)

# 创建游标对象
cursor = mydb.cursor()

# 用户输入数据
user_id = 1
question_id = 1
user_answer = "42"

# 执行SQL语句插入用户输入到数据库
sql = "INSERT INTO user_answers (user_id, question_id, user_answer) VALUES (%s, %s, %s)"
values = (user_id, question_id, user_answer)
cursor.execute(sql, values)

# 提交更改到数据库
mydb.commit()

# 关闭游标和数据库连接
cursor.close()
mydb.close()

上述代码中，我们首先使用mysql.connector模块连接到MySQL数据库。然后，我们创建一个游标对象，该对象用于执行SQL语句。接下来，我们定义了用户的ID、问题的ID和用户输入的答案。然后，我们执行了一个插入语句，将这些值插入到名为user_answers的表格中。最后，我们提交了更改，并关闭了游标和数据库连接。

请注意，上述示例仅展示了一种使用Python和MySQL数据库的方法。根据你使用的具体数据库和编程语言，代码会有所不同。