保护Python应用程序的一种常见方法是使用编译器或加密工具将源代码转换为可执行的二进制文件。这样做可以防止他人直接查看和修改源代码，增加应用程序的安全性。以下是一种解决方法的示例：

1. 使用pyinstaller工具编译Python源代码为可执行文件：

$ pyinstaller --onefile myapp.py

上述命令将会生成一个可执行文件myapp，可以直接运行。

2. 使用Cython将Python源代码编译为C语言扩展模块：

首先，安装Cython：

$ pip install cython

然后，创建一个.pyx文件，例如myapp.pyx，并编写Python源代码。接下来，创建一个setup.py文件，用于构建扩展模块：

from distutils.core import setup
from Cython.Build import cythonize

setup(
    ext_modules = cythonize("myapp.pyx")
)

最后，运行以下命令来构建扩展模块：

$ python setup.py build_ext --inplace

这将会生成一个.so或.pyd文件，可以导入并使用。

请注意，这些方法可以增加应用程序的安全性，但并不能完全防止源代码被逆向工程或篡改。其他安全措施如加密算法、代码混淆等可以进一步增强应用程序的保护性。