以下是用Python语言实现的一种解决方法：

def delete_duplicate_lines(file_path, num_bottom_lines):
    lines = []
    with open(file_path, 'r') as file:
        lines = file.readlines()
    unique_lines = list(set(lines))
    bottom_lines = unique_lines[-num_bottom_lines:]
    with open(file_path, 'w') as file:
        file.writelines(bottom_lines)

该函数delete_duplicate_lines接受两个参数：file_path表示文件路径，num_bottom_lines表示要保留的底部行数。

函数首先打开文件并读取所有行，然后使用set函数去除重复行，再将结果转换为列表。接下来，从去重后的列表中选择底部的num_bottom_lines行。最后，将保留的底部行写入原文件中并覆盖原内容。

使用示例：

delete_duplicate_lines('example.txt', 3)

上述示例将处理名为example.txt的文件，保留底部的3行并删除重复行，结果会覆盖原文件内容。