在Barba.js中，自定义CSS过渡有时可能不起作用。以下是一种可能的解决方法，其中包含代码示例：

1. 确保已正确引入Barba.js和相关的CSS过渡文件。

2. 创建自定义CSS过渡效果的JavaScript文件。在该文件中，您可以使用Barba.BaseTransition类来定义过渡的进入和离开效果。在这个示例中，我们将为进入和离开的页面定义了一个简单的淡入淡出效果。

// custom-transition.js

var FadeTransition = Barba.BaseTransition.extend({
  start: function() {
    // 进入页面的动画效果
    this.newContainerLoading.then(this.fadeIn.bind(this));
  },

  fadeIn: function() {
    // 隐藏旧页面
    this.oldContainer.style.opacity = 0;
    
    // 显示新页面
    this.newContainer.style.visibility = 'visible';
    
    // 淡入新页面
    anime({
      targets: this.newContainer,
      opacity: 1,
      duration: 1000,
      easing: 'easeInOutSine',
      complete: this.done.bind(this)
    });
  },

  done: function() {
    // 移除旧页面
    this.oldContainer.parentNode.removeChild(this.oldContainer);
    
    // 动画完成后，调用Barba.js的done()方法
    this.done();
  }
});

// 初始化Barba.js并将自定义过渡效果添加到Barba.Pjax中
Barba.Pjax.start();
Barba.Pjax.getTransition = function() {
  return FadeTransition;
};

3. 在HTML中添加data-barba-namespace属性，以确保自定义过渡效果能够应用于正确的元素。

4. 在页面加载时，将自定义过渡脚本添加到页面中。

通过按照上述步骤，您应该能够实现自定义CSS过渡效果。请确保在编写自定义过渡代码时，使用正确的选择器和动画库，以便与您的项目和需求匹配。