在大多数编程语言中，Base64编码不会因为无效字符而失败。当你尝试对一个包含无效字符的字符串进行Base64编码时，编码函数通常会忽略这些无效字符并继续编码有效字符。

下面是一些常见编程语言中进行Base64编码的示例代码：

Python:

import base64

string = "Hello, World!$#%"  # 包含无效字符的字符串
encoded_string = base64.b64encode(string.encode("utf-8"))
print(encoded_string.decode("utf-8"))  # 输出：SGVsbG8sIFdvcmxkIyM=

Java:

import java.util.Base64;

String string = "Hello, World!$#%"; // 包含无效字符的字符串
String encodedString = Base64.getEncoder().encodeToString(string.getBytes());
System.out.println(encodedString); // 输出：SGVsbG8sIFdvcmxkIyM=

JavaScript:

let string = "Hello, World!$#%"; // 包含无效字符的字符串
let encodedString = btoa(string);
console.log(encodedString); // 输出：SGVsbG8sIFdvcmxkIyM=

注意：尽管Base64编码不会因为无效字符而失败，但解码Base64字符串时，如果包含了无效字符，解码函数可能会抛出异常或返回错误的结果。在解码之前，最好先检查Base64字符串是否包含无效字符。