使用BEDtools提供的bedtools sort命令对BED文件进行排序,确保起始位置在前,终止位置在后。
代码示例:
bedtools sort -i input.bed > sorted.bed
其中,input.bed是原始的BED文件,sorted.bed是排序后的BED文件。排完序后再进行后续的操作即可避免该问题。
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