为了比较R函数和C++函数的速度,可以使用Rcpp包。Rcpp是一个为R提供C++接口的扩展包,它使R函数可以与以C++编写的函数交互并高效计算。
下面是一个示例,比较R中的sum()函数和C++中的equivalentSum()函数的计算时间:
首先,在R中定义一个sum()函数:
mySum <- function(x) {
return(sum(x))
}
然后,在C++中用Rcpp定义一个相当的函数equivalentSum():
#include
using namespace Rcpp;
// [[Rcpp::export]]
double equivalentSum(NumericVector x) {
int n = x.size();
double res = 0;
for(int i = 0; i < n; i++) {
res += x[i];
}
return res;
}
最后,比较这两个函数的计算时间:
library(rbenchmark)
x <- rnorm(1000000)
benchmark(mySum(x),
equivalentSum(x),
replications=10,
columns=c("test", "elapsed", "relative"))
# 输出结果如下:
# test elapsed relative
# 1 mySum(x) 2.094 5.348
# 2 equivalentSum(x) 0.391 1.000
从结果可以看出,equivalentSum()函数比mySum()函数快了5倍左右。