编写一个适配器删除工具,在序列中忽略大小写的建议。
创始人
2024-12-07 08:30:25
0

您可以使用Python中的re模块来实现忽略大小写的字符串匹配。下面是一个示例函数,其中包含一个参数adapter和一个参数sequence,用于将adapter从sequence中删除,并忽略大小写:

import re

def remove_adapter(adapter, sequence):
    pattern = re.compile(adapter, re.IGNORECASE)
    return re.sub(pattern, "", sequence)

示例用法:

adapter = "AGATCGG"
sequence = "agatcggccgtatagctcatacctaAGATCGGtattattcgcgcg"
result = remove_adapter(adapter, sequence)
print(result)  # 输出为 "ccgtatagctcatacctattattcgcgcg"

在这个示例中,函数创建了一个正则表达式模式,该模式可以匹配adapter而忽略大小写,然后使用re.sub()函数替换匹配项为空字符串,这样就可以从sequence中删除指定的adapter了。

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