你可以使用以下代码来比较两个包含科学值的列表的值，并返回最大值组成的新列表：

import numpy as np

def compare_lists(list1, list2):
    # 将两个列表转换为NumPy数组
    array1 = np.array(list1)
    array2 = np.array(list2)
    
    # 比较两个数组中对应位置的值，返回较大值的数组
    max_array = np.maximum(array1, array2)
    
    # 将NumPy数组转换为列表并返回
    result = max_array.tolist()
    return result

# 示例输入
list1 = [1.234e+05, 2.345e-03, 3.456e+08]
list2 = [5.678e+04, 1.234e+06, 7.890e-04]

# 调用函数并打印结果
result = compare_lists(list1, list2)
print(result)

该代码使用NumPy库将列表转换为NumPy数组，并使用np.maximum()函数比较两个数组中对应位置的值，返回较大值的数组。最后，通过tolist()方法将NumPy数组转换为列表，并将结果打印输出。

输出结果为：[1.234e+05, 1.234e+06, 3.456e+08]，即两个列表中对应位置的较大值组成的新列表。