在Git合并过程中避免覆盖文件的方法主要是使用合并工具来解决冲突。下面是一个具体的解决方法示例：

1. 首先，将两个分支合并到一个新的分支上：

git checkout -b merge-branch
git merge branch1
git merge branch2

2. 如果在合并过程中出现了冲突，Git会在冲突的文件中标记出冲突的部分。打开冲突文件，会看到类似以下的标记：

<<<<<<< HEAD
// 当前分支的修改内容
=======
// 合并分支的修改内容
>>>>>>> branch1

3. 根据具体情况，决定保留哪些修改或者如何修改。可以手动编辑冲突文件，或者使用合并工具来解决冲突。

4. 如果手动编辑，需要删除冲突标记并保留需要的修改内容。

5. 如果使用合并工具，可以使用git mergetool命令来打开合并工具。常见的合并工具有vimdiff、Beyond Compare、KDiff3等。根据自己的喜好选择合适的合并工具。

git mergetool

6. 解决冲突后，保存文件并退出合并工具。

7. 继续执行合并操作，直到所有冲突都解决完毕。

8. 最后，完成合并并提交修改：

git add .
git commit -m "Merge branch1 and branch2"

这样就可以避免在Git合并过程中覆盖文件，并成功解决冲突。