安装R包时出现“gcc-12error(e.g.DESeq2)的错误提示。
创始人
2024-08-30 13:00:53
0次

在命令行中使用以下命令来解决该问题:

1.先检查系统已安装的gcc版本:

 gcc --version

2.如果系统存在较新版本的gcc,但R仍要求较旧的gcc版本,可以按照以下步骤安装旧版本的gcc:

 sudo apt-get update
 sudo apt-get install gcc-6

3.检查gcc-6版本是否正确安装:

 gcc-6 --version

4.告诉R使用新安装的gcc-6版本:

 sudo R CMD javareconf
 Rscript -e 'Sys.setenv(CC = "/usr/bin/gcc-6"); install.packages("DESeq2")'

注意:DESeq2可替换为出现错误的其他包名称。另外,此方法仅在Ubuntu系统中测试过,其它Linux发行版可能有所不同。

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