BioSeqIO不能识别.gbff文件 _程序开发

创始人

2024-12-19 02:00:49

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使用biopython中的SeqIO库替换BioSeqIO来读取.gbff文件。

示例代码：

from Bio import SeqIO

records = SeqIO.parse("path/to/file.gbff", "genbank")

for record in records:
    print(record.id)

其中"path/to/file.gbff"为.gbff文件的路径。使用SeqIO.parse()方法来读取文件，第二个参数为文件类型，"genbank"表示.gbff文件。然后就可以像操作其他类型的序列文件一样操作.gbff文件了。

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