有时候，当将BitBucket Pipelines在服务器上直接执行时，它可能不会执行整个shell脚本。这可能是由于一些配置或权限问题导致的。下面是一种可能的解决方法：

1. 确保您的服务器具有执行脚本的权限。您可以使用chmod命令来为脚本添加执行权限。例如，如果您的脚本名为script.sh，您可以运行以下命令来添加执行权限：

chmod +x script.sh

2. 确保您的脚本以正确的方式开始。您的脚本应该以#!/bin/sh或#!/bin/bash开头，具体取决于您使用的shell。例如，对于bash，您可以在脚本的第一行添加以下内容：

#!/bin/bash

3. 在BitBucket Pipelines配置文件中，确保您正确指定了要执行的脚本。例如，如果您的脚本名为script.sh，则您的配置文件中应该包含以下内容：

pipelines:
  default:
    - step:
        script:
          - ./script.sh

4. 在BitBucket Pipelines的日志中查找任何错误消息或警告。如果有任何错误消息或警告出现，它们可能会提供有关为什么脚本没有完全执行的线索。

5. 检查您的脚本是否具有正确的退出状态。如果您的脚本以非零退出状态终止，BitBucket Pipelines可能会认为脚本失败，并停止执行其余的步骤。确保您的脚本在完成后以零退出状态终止。例如，您可以在脚本的末尾添加以下内容：

exit 0

通过执行上述步骤，您应该能够解决BitBucket Pipelines在服务器上直接执行时不执行整个shell脚本的问题。