在部署到Google App Engine时，可以通过以下步骤获取NPM调试日志：

1. 确保在本地开发环境中已经成功运行并调试了应用程序。

2. 在项目的根目录中，创建一个名为app.yaml的文件，用于配置App Engine。

3. 在app.yaml文件中添加以下内容：

runtime: nodejs
env: flex

manual_scaling:
  instances: 1
  
env_variables:
  NPM_CONFIG_LOGLEVEL: debug

4. 在package.json文件中，添加一个start脚本，用于启动应用程序：

"scripts": {
  "start": "node index.js"
}

5. 在部署之前，使用以下命令安装依赖项：

npm install

6. 使用以下命令部署应用程序到App Engine：

gcloud app deploy

7. 部署完成后，可以通过以下命令查看日志：

gcloud app logs tail -s default

这将输出应用程序的日志，包括NPM的调试日志。

请注意，上述示例假设您使用的是Node.js运行时环境，如果您使用的是其他语言或环境，请相应地调整配置文件和命令。