要构建JS应用程序并使用Yarn进行部署，你可以按照以下步骤进行操作：

1. 确保已安装Node.js和Yarn。你可以在命令行中输入以下命令来检查它们的版本：

node -v
yarn -v

2. 在你的应用程序根目录下，创建一个package.json文件，其中包含你的项目依赖和脚本配置。你可以使用以下命令来初始化package.json文件：

yarn init -y

3. 使用Yarn安装所需的依赖项。例如，如果你的应用程序使用React，你可以运行以下命令来安装React和相关的依赖项：

yarn add react react-dom

4. 在package.json中，你可以添加一个用于构建应用程序的脚本。编辑scripts字段，将其设置为以下内容：

"scripts": {
  "build": "webpack --mode production"
}

这里假设你使用Webpack作为构建工具，并将构建模式设置为production，你可以根据你的实际情况进行调整。

5. 创建一个Webpack配置文件，例如webpack.config.js，并配置你的应用程序的构建选项。以下是一个简单的示例：

const path = require('path');

module.exports = {
  entry: './src/index.js',
  output: {
    path: path.resolve(__dirname, 'dist'),
    filename: 'bundle.js'
  },
  module: {
    rules: [
      {
        test: /\.js$/,
        exclude: /node_modules/,
        use: {
          loader: 'babel-loader',
          options: {
            presets: ['@babel/preset-env', '@babel/preset-react']
          }
        }
      }
    ]
  }
};

这个示例中，我们指定了应用程序的入口文件为src/index.js，输出文件为dist/bundle.js。我们还配置了Babel来处理JS文件，并使用@babel/preset-env和@babel/preset-react进行转译。

6. 运行构建命令以构建你的应用程序。在命令行中输入以下命令：

yarn build

这将使用Webpack根据你的配置文件构建应用程序，并生成一个打包后的文件。

7. 构建完成后，你可以将生成的文件部署到你的服务器或托管服务上。将生成的dist/bundle.js文件和其他必要的文件上传到服务器，并确保服务器上已配置正确的静态文件服务。

这样，你就可以使用Yarn来构建和部署你的JS应用程序了。根据你的实际需求，你可能需要进一步调整配置和添加其他构建步骤。