不同版本的SQL Server命令行工具与不同版本的SQL Server的兼容性可能会有一些差异。以下是一些解决方法和代码示例：

1. 使用正确的命令行工具版本：不同版本的SQL Server可能需要使用不同的命令行工具版本。例如，SQL Server 2012和更早版本需要使用"sqlcmd"命令行工具，而SQL Server 2014及更高版本需要使用"sqlcmd.exe"命令行工具。

2. 检查命令行工具的版本：在命令提示符中运行以下命令可以检查命令行工具的版本：

   sqlcmd -?    -- 对于SQL Server 2012及更早版本
   sqlcmd.exe -?    -- 对于SQL Server 2014及更高版本
   

   这将显示命令行工具的版本信息，以确保使用正确的版本。

3. 使用兼容的命令和语法：不同版本的SQL Server可能支持不同的命令和语法。在使用命令行工具执行SQL脚本时，确保使用兼容的命令和语法。根据需要，可以根据不同的SQL Server版本编写条件逻辑。

   例如，以下代码示例演示了如何使用条件逻辑来执行不同版本的SQL Server：

   -- SQL Server 2012及更早版本
   IF (SELECT SERVERPROPERTY('ProductVersion')) LIKE '11.%'
   BEGIN
       -- 适用于SQL Server 2012的命令和语法
   END
   
   -- SQL Server 2014及更高版本
   IF (SELECT SERVERPROPERTY('ProductVersion')) LIKE '12.%'
   BEGIN
       -- 适用于SQL Server 2014的命令和语法
   END
   

   在这个示例中，根据SQL Server的版本，你可以编写不同的代码块来处理兼容性问题。

4. 更新命令行工具和SQL Server：如果在使用命令行工具时遇到兼容性问题，可以尝试更新命令行工具和SQL Server的版本。通过安装最新的服务包和更新程序，可以解决许多兼容性问题。

总之，要解决不同版本的SQL Server命令行工具与不同版本的SQL Server的兼容性问题，首先确保使用正确的命令行工具版本，并检查命令行工具的版本。然后，根据不同的SQL Server版本编写条件逻辑来处理兼容性问题。如果问题仍然存在，可以尝试更新命令行工具和SQL Server的版本。