可以使用GraphQL中的接口和联合类型来解决该问题。首先定义一个接口或联合类型，其中包含基础类型和子类型，然后可以使用不同的包含方式查询不同类型。

以下是一个示例：

interface Vehicle {
  id: ID!
  brand: String!
}

type Car implements Vehicle {
  id: ID!
  brand: String!
  model: String!
}

type Bike implements Vehicle {
  id: ID!
  brand: String!
  numberOfWheels: Int!
}

type Query {
  vehicles: [Vehicle!]!
  cars: [Car!]!
  bikes: [Bike!]!
}

在上面的示例中，我们定义了一个接口Vehicle，以及两种子类型：Car和Bike。然后我们定义了三个查询方法：vehicles、cars和bikes。

现在我们可以使用不同的包含方式查询基础类型和子类型。例如，下面是一个查询所有车辆的方法：

{
  vehicles {
    id
    brand
    ... on Car {
      model
    }
    ... on Bike {
      numberOfWheels
    }
  }
}

在上面的查询中，我们使用了不同的包含方式来获得基础类型和子类型的特定字段。使用on关键字和类型名称，我们可以对特定类型执行特定的操作。

通过使用接口和联合类型，我们可以避免使用不同的包含方式查询基础类型和子类型时出现的问题。