在Apache Calcite中，可以通过使用RelBuilder来保留group by/having/order by中的别名。下面是一个示例代码：

import org.apache.calcite.rel.RelNode;
import org.apache.calcite.rel.RelRoot;
import org.apache.calcite.rel.logical.LogicalAggregate;
import org.apache.calcite.rel.rules.ProjectRemoveRule;
import org.apache.calcite.rel.rules.SubQueryRemoveRule;
import org.apache.calcite.sql.SqlKind;
import org.apache.calcite.sql.SqlNode;
import org.apache.calcite.sql.parser.SqlParser;
import org.apache.calcite.sql.parser.SqlParserConfig;
import org.apache.calcite.sql.parser.SqlParserImplFactory;
import org.apache.calcite.sql.parser.impl.SqlParserImplFactoryImpl;
import org.apache.calcite.tools.FrameworkConfig;
import org.apache.calcite.tools.Frameworks;
import org.apache.calcite.tools.Planner;
import org.apache.calcite.tools.RelBuilder;
import org.apache.calcite.tools.RuleSets;

public class AliasPreservationExample {
    public static void main(String[] args) {
        // 创建一个RelBuilder实例
        RelBuilder builder = createRelBuilder();

        // 构建查询
        builder.scan("employees")
                .aggregate(builder.groupKey(builder.field("department_id")), builder.alias(builder.count(), "total"))
                .project(builder.field("department_id"), builder.field("total"))
                .build();

        // 获取构建的RelNode
        RelNode relNode = builder.build();

        // 打印查询的SQL语句
        System.out.println(relNode.explain());

        // 执行查询并获取结果
        // ...

    }

    private static RelBuilder createRelBuilder() {
        // 创建一个FrameworkConfig实例
        FrameworkConfig config = Frameworks.newConfigBuilder()
                .parserConfig(SqlParser.configBuilder()
                        .setParserFactory(new SqlParserImplFactoryImpl())
                        .build())
                .defaultSchema(SchemaUtil.createSampleSchema())
                .ruleSets(RuleSets.ofList(
                        ProjectRemoveRule.INSTANCE,
                        SubQueryRemoveRule.INSTANCE))
                .build();

        // 创建一个Planner实例
        Planner planner = Frameworks.getPlanner(config);

        // 创建一个RelBuilder实例
        return RelBuilder.create(config);
    }
}

在上面的示例中，我们首先创建了一个RelBuilder实例，然后使用RelBuilder的方法来构建查询计划。在构建查询计划时，我们使用builder.alias(builder.count(), "total")来为聚合函数count()设置别名为"total"。最后，我们通过调用builder.build()来获取构建的RelNode。

要保留group by/having/order by中的别名，我们在创建FrameworkConfig实例时使用了两个规则集：ProjectRemoveRule.INSTANCE和SubQueryRemoveRule.INSTANCE。这些规则集将确保在查询优化过程中保留别名。

通过上述代码示例，我们可以在Apache Calcite中保留group by/having/order by中的别名。在实际应用中，你可以根据自己的需求来构建复杂的查询计划。