在不同的Python版本中，可以使用不同的方法来管理setuptools的依赖。

在Python 2中，可以使用setuptools模块的install_requires参数来指定依赖项。例如：

from setuptools import setup

setup(
    ...
    install_requires=[
        'dependency1',
        'dependency2',
    ],
    ...
)

在Python 3中，可以使用setuptools模块的setup_requires参数来指定依赖项。例如：

from setuptools import setup

setup(
    ...
    setup_requires=[
        'dependency1',
        'dependency2',
    ],
    ...
)

在Python 3.3及更高版本中，还可以使用pyproject.toml文件来管理依赖项。在pyproject.toml文件中，使用build-system部分来指定构建系统和依赖项。例如：

[build-system]
requires = [
    "dependency1",
    "dependency2"
]

然后，在setup.py文件中，使用setuptools的setup()函数来读取pyproject.toml文件。例如：

from setuptools import setup

setup(
    ...
    use_scm=True,
    ...
)

这样，setuptools会自动读取pyproject.toml文件中的依赖项。

需要注意的是，Python 2和Python 3之间的依赖管理的方法存在差异，因此在开发跨Python版本的项目时，需要根据具体的Python版本来选择使用不同的方法来管理setuptools的依赖。