可以使用clojure中提供的interop函数将apache-commons-matrix和core.matrix进行转换，使其能够兼容。具体实现方法如下所示：

(ns myproject.core
  (:require [clojure.core.matrix :as matrix]
            [clojure.java.jniloader :as jni]
            [org.apache.commons.math3.linear :as apache-matrix]))

; 加载本地库
(jni/load "liblapack.so") 

; 定义一个将apache-matrix转换为core.matrix格式的函数
(defn apache->core-matrix [m]
   (matrix/matrix
    (vec (map #(vec %) (.getData m)))
    (map keyword (.getRowNames m))
    (map keyword (.getColumnNames m))))

; 定义一个将core.matrix转换为apache-matrix格式的函数
(defn core->apache-matrix [m]
  (let [rows (matrix/dimension m 0)
        cols (matrix/dimension m 1)]
    (doto (new  apache-matrix/Array2DRowRealMatrix rows cols)
      (.setSubMatrix (map vec (matrix/rows m)) 0 0)
      (.setRowNames (map name (matrix/row-names m)))
      (.setColumnNames (map name (matrix/column-names m))))))

; 定义一个使用apache-commons-matrix的函数
(defn apache-matrix-func []
  (let [m (new apache-matrix/Array2DRowRealMatrix [[1.0 2.0] [3.0 4.0]])]
    (.multiply m m)))

; 定义一个使用core.matrix的函数
(defn core-matrix-func []
  (let [a (matrix/matrix [[1.0 2.0] [3.0 4.0]])
        b (matrix/matrix [[5.0] [6.0]])]
    (matrix/* a b)))

; 调用apache-commons-matrix的函数
(apache-matrix-func) ; [7.0 10.0][15.0 22.0]

; 调用core.matrix的