在Apache Beam 2.39.0的DataFlow runner中使用BigQuery Storage API时，可能会遇到权限拒绝的问题。这是因为默认情况下，DataFlow runner使用Google Cloud Storage API而不是BigQuery Storage API，因此需要进行以下更改：

1. 在pom.xml（或build.gradle）中添加以下依赖项：

    org.apache.beam
    beam-sdks-java-io-google-cloud-platform
    2.39.0

2. 在代码中使用BigQueryIO.Read或BigQueryIO.Write：

PCollection rows = pipeline.apply(BigQueryIO.readTableRows()
        .from("my-project:my_dataset.my_table")
        .usingStandardSql()
        .withMethod(Method.DIRECT_READ)
        .withStorageReadOptions(new StorageReadOptions()
              .withFormatOptions(new AvroOptions())
              .withSelectedFields(Arrays.asList("field1", "field2"))))

请注意，使用BigQuery Storage API需要在Google Cloud Console中启用BigQuery Storage API并授权相应的IAM权限。