Apache Beam的BigQuery IO连接器可以使用BigQuery的外部表，但是需要在连接器中设置相关参数。具体来说，需要在创建BigQueryIO.Write或BigQueryIO.Read对象时，设置withMethod参数为BigQueryIO.TypedWrite.Method.FILE_LOADS或BigQueryIO.TypedRead.Method.EXPORT。然后，需要设置withFormatFunction参数为FileFormat.JSON或withFormatFunction参数为FormatOptions.csv()，分别对应JSON格式和CSV格式的外部表。 以下是使用Java代码实现对外部表操作的示例：

Pipeline pipeline = Pipeline.create(options);
PCollection rows = pipeline.apply(BigQueryIO.readTableRows()
    .fromQuery("")
    .withMethod(BigQueryIO.TypedRead.Method.EXPORT)
    .withFormatFunction(FormatOptions.csv()));

rows.apply(BigQueryIO.writeTableRows()
    .to("")
    .withMethod(BigQueryIO.TypedWrite.Method.FILE_LOADS)
    .withFormatFunction(FileFormat.JSON));

以上代码将通过BigQuery的EXPORT方法读取内部表中的数据，并将其写入JSON格式的外部表。