当在Apache服务器上更改了php.ini文件的配置后，但并没有加载这些更改时，可能是因为以下几个原因：

1. 未重启Apache服务器：在更改php.ini文件后，需要重启Apache服务器才能加载新的配置。可以使用以下命令重启Apache服务器：

sudo service apache2 restart

2. 配置错误：检查是否在php.ini文件中正确地进行了更改。可能是语法错误或路径错误导致配置无效。确保在修改php.ini文件时使用正确的语法，并且路径是正确的。

3. 配置被覆盖：有时，Apache服务器可能加载多个php.ini文件，其中一个文件中的配置可能会覆盖另一个文件中的配置。可以通过以下步骤确定加载的php.ini文件的位置：

   a. 在网页中创建一个phpinfo.php文件，并将以下代码复制到文件中：

   b. 将phpinfo.php文件放置在Apache服务器的文档根目录中。

   c. 在浏览器中访问phpinfo.php文件，例如：http://localhost/phpinfo.php。

   d. 在phpinfo页面中查找“Loaded Configuration File”字段，该字段显示当前加载的php.ini文件的路径。确保在相应的php.ini文件中进行更改。

4. 文件权限问题：确保php.ini文件及其父目录的权限正确设置。可以使用以下命令更改文件和目录的权限：

sudo chmod 644 /path/to/php.ini
sudo chmod 755 /path/to/parent/directory

如果以上方法无效，可以尝试在Apache的配置文件中直接设置php配置，而不是通过php.ini文件。在Apache的配置文件（通常是httpd.conf或apache2.conf）中添加以下行：

php_value  

其中是要更改的PHP配置指令，是相应的值。例如，要更改max_execution_time指令的值为60秒，可以添加以下行：

php_value max_execution_time 60

保存更改后，重启Apache服务器使配置生效。