要在ApexCharts中创建一个带有非常小数字的轴，可以使用yaxis对象的labels属性来自定义轴标签。下面是一个示例代码：

var options = {
  chart: {
    type: 'line',
  },
  series: [{
    name: 'Series 1',
    data: [0.00001, 0.00002, 0.00003, 0.00004, 0.00005]
  }],
  xaxis: {
    categories: ['A', 'B', 'C', 'D', 'E']
  },
  yaxis: {
    labels: {
      formatter: function(value) {
        // 将数字转换为科学计数法
        return value.toExponential(2);
      }
    }
  }
}

var chart = new ApexCharts(document.querySelector("#chart"), options);
chart.render();

在上面的示例中，formatter函数被用于自定义轴标签的格式。在这个函数中，toExponential方法被用于将数字转换为科学计数法。你可以根据需要自定义轴标签的格式。最后，使用render方法将图表渲染到指定的DOM元素中（这里是一个ID为"chart"的元素）。