要禁用Android Studio中的直接运行Android模拟器功能，你可以按照以下步骤进行操作：

1. 打开Android Studio，并点击顶部菜单栏中的“File”（文件）选项。

2. 在下拉菜单中，选择“Settings”（设置）选项。

3. 在弹出的设置窗口中，展开“Tools”（工具）部分，并选择“Emulator”（模拟器）选项。

4. 在右侧的窗格中，取消选中“Launch in a tool window”（在工具窗口中启动）复选框。

5. 点击底部的“Apply”（应用）或“OK”（确定）按钮，保存更改并关闭设置窗口。

现在，当你点击“Run”（运行）按钮时，Android Studio将不再直接启动Android模拟器，而是打开一个独立的模拟器窗口。

以下是一个代码示例，展示了如何在Android项目的build.gradle文件中禁用直接运行Android模拟器的功能：

android {
    // ...
    
    // 禁用直接运行Android模拟器
    gradle.startParameter.systemPropertiesArgs = ['-Ddisable.android.run=true']
    
    // ...
}

将上述代码添加到你的项目的build.gradle文件中，并重新构建项目即可。

请注意，这只是一个示例，具体的实现方式可能因项目的结构和需求而有所不同。