是的，Android Instant App可以有多个基础模块。每个基础模块都是一个独立的代码模块，可以包含自己的Java代码、资源文件和布局文件。

以下是一个示例，展示如何在Instant App中创建多个基础模块：

1. 在项目的根目录中的settings.gradle文件中，添加每个基础模块的引用。例如，假设你有两个基础模块module1和module2，在settings.gradle文件中添加如下代码：

include ':app', ':module1', ':module2'

2. 在每个基础模块的build.gradle文件中，设置正确的依赖关系。例如，在module1的build.gradle文件中添加如下代码：

dependencies {
    implementation project(':app')
    // 添加其他依赖关系
}

3. 在主模块（通常是app模块）的AndroidManifest.xml文件中，声明每个基础模块的入口点。例如，在app模块的AndroidManifest.xml文件中添加如下代码：

4. 在每个基础模块中实现所需的功能。例如，在module1模块中创建一个名为SampleActivity的Activity：

public class SampleActivity extends AppCompatActivity {
    // 实现所需的功能
}

请注意，这只是一个示例，你可以根据自己的需求和项目结构进行调整。