在App-V调用VMFS中的Exe文件时，可能是由于环境变量的问题导致的。下面是一个示例代码，展示了如何通过设置环境变量解决这个问题：

using System;
using System.Diagnostics;

namespace AppVVMFSExample
{
    class Program
    {
        static void Main(string[] args)
        {
            // 设置环境变量
            Environment.SetEnvironmentVariable("VMFS_PATH", "C:\\Path\\to\\VMFS");

            // 调用Exe文件
            ProcessStartInfo startInfo = new ProcessStartInfo();
            startInfo.FileName = "C:\\Path\\to\\VMFS\\example.exe";
            startInfo.UseShellExecute = false;
            startInfo.RedirectStandardOutput = true;

            using (Process process = Process.Start(startInfo))
            {
                // 等待进程结束并获取输出
                process.WaitForExit();
                string output = process.StandardOutput.ReadToEnd();

                // 处理输出
                Console.WriteLine(output);
            }
        }
    }
}

这个示例代码中，首先使用Environment.SetEnvironmentVariable()方法设置了一个名为VMFS_PATH的环境变量，该变量的值是VMFS的路径。然后，通过Process.Start()方法启动了一个进程，指定了要调用的Exe文件的路径。在Process.StartInfo中，我们设置了UseShellExecute为false，这样可以避免使用默认的Shell来启动进程。同时，我们还将RedirectStandardOutput设置为true，这样可以获取进程的输出。

在进程执行完成后，我们使用WaitForExit()方法等待进程结束，并使用StandardOutput.ReadToEnd()方法获取进程的输出。最后，我们可以对输出进行处理，例如打印到控制台。

请注意，上述代码仅为示例，实际使用时，你需要根据自己的环境和需求进行适当的修改。