在AppVeyor CI中，您可以使用构建脚本来在Linux上执行自定义命令，并使用MSBuild在Windows上构建您的项目。

首先，您需要在您的项目的根目录中创建一个名为appveyor.yml的文件，该文件将用于配置构建过程。以下是一个示例appveyor.yml文件：

# Linux 构建配置
build:
  project: |
    ./build.sh
  parallel: true

# Windows 构建配置
platform:
  - x86
  - x64

configuration:
  - Debug
  - Release

# 在 Windows 上使用 MSBuild 构建
build_script:
  - msbuild.exe MyProject.sln /p:Configuration=%CONFIGURATION% /p:Platform=%PLATFORM%

在这个例子中，我们首先配置了Linux上的构建过程。build部分指定了要运行的脚本文件build.sh，并设置了parallel选项以并行运行多个作业。您可以根据自己的需求修改build.sh脚本。

接下来，我们配置了Windows上的构建过程。platform部分指定了要构建的平台（x86和x64），configuration部分指定了要构建的配置（Debug和Release）。build_script部分使用msbuild.exe命令来构建解决方案文件MyProject.sln，并根据配置和平台进行相应的设置。

请注意，这只是一个示例配置，您需要根据您的项目的实际情况进行适当的修改。

在构建过程中，AppVeyor CI将首先执行Linux上的构建脚本，然后切换到Windows上使用MSBuild构建项目。这样，您就可以在AppVeyor CI中同时在Linux和Windows上进行构建。

希望这个解决方案能对您有所帮助！