要自定义身份验证ASP.NET Core 3.1，可以按照以下步骤进行：

1. 创建自定义的身份验证处理程序：

using Microsoft.AspNetCore.Authentication;
using Microsoft.AspNetCore.Http;
using Microsoft.Extensions.Logging;
using Microsoft.Extensions.Options;
using System.Linq;
using System.Security.Claims;
using System.Text.Encodings.Web;
using System.Threading.Tasks;

public class CustomAuthenticationHandler : AuthenticationHandler
{
    public CustomAuthenticationHandler(IOptionsMonitor options, ILoggerFactory logger, UrlEncoder encoder, ISystemClock clock) : base(options, logger, encoder, clock) { }

    protected override async Task HandleAuthenticateAsync()
    {
        // 自定义身份验证逻辑
        var claims = new[] { new Claim(ClaimTypes.Name, "username") };
        var identity = new ClaimsIdentity(claims, Scheme.Name);
        var principal = new ClaimsPrincipal(identity);
        var ticket = new AuthenticationTicket(principal, Scheme.Name);

        return await Task.FromResult(AuthenticateResult.Success(ticket));
    }
}

2. 注册自定义的身份验证处理程序：

services.AddAuthentication("CustomAuthentication")
    .AddScheme("CustomAuthentication", null);

3. 在需要进行身份验证的地方调用认证：

[Authorize(AuthenticationSchemes = "CustomAuthentication")]
public IActionResult SecureAction()
{
    // 被身份验证保护的操作
    return View();
}

这样就可以自定义身份验证ASP.NET Core 3.1了。请注意，以上只是一个示例，你需要根据自己的实际需求来实现自定义身份验证逻辑。