在Android Studio中，如果您的多模块项目没有模块之间的依赖关系，您可以按照以下步骤生成R文件。

1. 在项目的根目录下的build.gradle文件中添加以下代码：

task generateRFiles {
    doLast {
        // 遍历所有的子模块
        project.subprojects { subproject ->
            // 获取每个子模块的路径
            def modulePath = subproject.path.replace(':', '/')
            // 获取每个子模块的包名
            def packageName = subproject.android.defaultConfig.applicationId
            // 生成R文件的命令
            def generateRCommand = "javac -source 1.7 -target 1.7 -d ${subproject.buildDir}/generated/source/r -classpath ${android.sdkDirectory}/platforms/${android.compileSdkVersion}/android.jar -sourcepath ${subproject.projectDir}/src/main/java ${subproject.projectDir}/src/main/java/${modulePath}/R.java"
            
            // 执行生成R文件的命令
            project.exec {
                commandLine generateRCommand.split(' ')
            }
            
            // 移动生成的R文件到对应的子模块包中
            project.copy {
                from "${subproject.buildDir}/generated/source/r/${modulePath}"
                into "${subproject.projectDir}/src/main/java/${modulePath}"
                include '**/*.java'
                filter { line ->
                    line.replaceAll('package .*;', "package ${packageName};")
                }
            }
        }
    }
}

2. 在根项目的settings.gradle文件中，添加以下代码来定义生成R文件的任务：

include ':app', ':module1', ':module2' // 添加所有的模块

def modulesWithoutDependency = [':module1', ':module2'] // 定义没有依赖关系的模块

// 遍历没有依赖关系的模块，为每个模块创建一个generateRFiles任务
modulesWithoutDependency.each { moduleName ->
    // 拼接任务名
    def taskName = "generateRFilesFor${moduleName.replace(':', '').capitalize()}"
    // 创建任务
    task(taskName, dependsOn: moduleName + ':generateRFiles') {}
    
    // 把任务添加到根任务中
    rootProject.generateRFiles.dependsOn taskName
}

3. 现在，您可以在Android Studio的Gradle任务面板中找到generateRFiles任务，并运行它。这将为没有依赖关系的每个模块生成R文件，并将其放置在相应的包中。

请注意，在执行生成R文件的任务之前，确保所有的模块都已经构建成功。如果需要，可以先构建项目，然后再执行生成R文件的任务。

希望以上步骤能帮助您在Android Studio中为没有模块依赖关系的多模块项目生成R文件。