要解决这个问题，可以使用以下代码示例：

在Global.asax.cs文件中，添加以下代码：

protected void Application_BeginRequest()
{
    // 仅在第一个请求时启用Windows身份验证
    if (Request.Url.AbsolutePath.EndsWith(".css") || Request.Url.AbsolutePath.EndsWith(".js"))
    {
        // 启用Windows身份验证
        HttpContext.Current.Response.AddHeader("WWW-Authenticate", "Negotiate");
        HttpContext.Current.Response.AddHeader("WWW-Authenticate", "NTLM");
        HttpContext.Current.Response.StatusCode = 401;
        HttpContext.Current.Response.End();
    }
}

上述代码在每个请求开始时进行检查，如果请求的文件是.css或.js文件，则会启用Windows身份验证。通过添加相应的WWW-Authenticate头和401状态码，强制浏览器在后续请求中提供Windows凭据。

请注意，这只是一个示例代码，你可能需要根据你的具体情况进行适当的修改和调整。