在ASP.NET MVC中使用EF Designer从数据库生成的Identity时出现问题的解决方法如下：

首先，确保已正确配置了ASP.NET Identity。可以在Startup.cs文件的ConfigureServices方法中添加以下代码：

services.AddIdentity()
    .AddEntityFrameworkStores()
    .AddDefaultTokenProviders();

然后，确保EF Designer生成的Identity模型与应用程序的上下文类（通常是ApplicationDbContext类）正确匹配。例如，Identity模型可能如下所示：

public class ApplicationUser : IdentityUser
{
    // 可以在此处添加自定义属性
}

public class ApplicationDbContext : IdentityDbContext
{
    public ApplicationDbContext(DbContextOptions options)
        : base(options)
    {
    }
    
    // 可以在此处添加其他DbSet属性和配置
}

接下来，检查数据库连接字符串是否正确，并确保数据库已正确创建。可以使用以下代码在Startup.cs文件的Configure方法中创建数据库：

using (var serviceScope = app.ApplicationServices.GetRequiredService().CreateScope())
{
    var dbContext = serviceScope.ServiceProvider.GetService();
    dbContext.Database.EnsureCreated();
}

现在，可以在控制器中使用ASP.NET Identity。例如，可以在AccountController中添加以下代码来处理用户注册：

[HttpPost]
[AllowAnonymous]
[ValidateAntiForgeryToken]
public async Task Register(RegisterViewModel model)
{
    if (ModelState.IsValid)
    {
        var user = new ApplicationUser { UserName = model.Email, Email = model.Email };
        var result = await _userManager.CreateAsync(user, model.Password);
        if (result.Succeeded)
        {
            // 注册成功的逻辑
            return RedirectToAction(nameof(HomeController.Index), "Home");
        }
        else
        {
            // 注册失败的逻辑，显示错误消息
            foreach (var error in result.Errors)
            {
                ModelState.AddModelError(string.Empty, error.Description);
            }
        }
    }

    // 如果有任何验证错误，返回注册视图
    return View(model);
}

以上是解决ASP.NET MVC中使用EF Designer生成的Identity不工作的一般步骤和示例代码。请根据具体情况进行调整和修改。