要解决ASP.NET MVC应用程序中Bootstrap模态窗口未正确显示和行为不正确的问题，可以按照以下步骤进行操作：

1. 确保正确引用Bootstrap库：在ASP.NET MVC项目中，确保已正确引用Bootstrap库。可以通过在项目中的head部分添加以下代码来引用Bootstrap：

确保这些链接在主布局文件（通常是_Layout.cshtml）中的head部分。

2. 检查模态窗口的HTML结构：确保模态窗口的HTML结构正确。通常，模态窗口的结构应类似于以下示例：

  

    

      

        ×
        
Modal Title
      
      

        
Modal Content
      
      

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确保模态窗口具有正确的id（在此示例中为myModal），并且各个部分（标题、内容、页脚）都存在。

3. 添加JavaScript代码：确保在模态窗口的显示和行为方面添加了必要的JavaScript代码。可以在主布局文件的底部，或者在需要使用模态窗口的视图文件中添加以下代码：

这段代码将在页面加载完成后自动显示模态窗口。

4. 检查可能的冲突：如果模态窗口仍然未正确显示或行为不正确，可能存在其他JavaScript库或代码与Bootstrap冲突。尝试在浏览器的开发者工具控制台中查看是否存在任何错误或冲突，并相应地解决它们。

通过以上步骤，您应该能够解决ASP.NET MVC应用程序中Bootstrap模态窗口未正确显示和行为不正确的问题。