要将Android Studio深度链接到特定应用程序的权限设置，可以按照以下步骤进行操作：

1. 在AndroidManifest.xml文件中注册一个深度链接的intent过滤器。在标签内添加以下代码：

将"your_scheme"替换为你自己的scheme。

2. 在你的应用程序中处理深度链接的intent。在你的Activity的onCreate()方法中，添加以下代码：

Intent intent = getIntent();
Uri data = intent.getData();
if (data != null && data.getScheme().equals("your_scheme")) {
    // 处理深度链接的逻辑
}

将"your_scheme"替换为你在第一步中注册的scheme。

3. 在Android Studio中使用adb命令发送深度链接的intent。打开终端窗口，并运行以下命令：

adb shell am start -W -a android.intent.action.VIEW -d "your_scheme://your_data"

将"your_scheme"替换为你在第一步中注册的scheme，将"your_data"替换为你想要传递给应用程序的数据。

通过以上步骤，你可以在Android Studio中深度链接到特定应用程序的权限设置。