为了解决ASP.Net Core 6.0中Session在iframe中不能保持的问题，可以尝试以下几种方法：

1.在启用了Session的Endpoint配置中添加RequireCors：

services.AddSession(options =>
{
    options.Cookie.IsEssential = true;
    options.IdleTimeout = TimeSpan.FromMinutes(30);
});

services.AddCors(); //添加Cors

app.UseEndpoints(endpoints =>
{
    endpoints.MapControllers().RequireCors("AllowAll");
});

2. 在iframe的源代码中，在主页URL中添加/路径：

3.将Session配置从UseMvc改为UseRouting和UseEndpoints：

app.UseRouting();
app.UseSession();
app.UseEndpoints(endpoints =>
{
    endpoints.MapRazorPages();
    endpoints.MapControllers();
});

通过使用以上解决方法之一，ASP.Net Core 6.0中Session在iframe中的问题应该会得到修复。