在ASP.NET MVC和Entity Framework中使用自定义方法时，可以通过多种方式实现。以下是在实体类、辅助类或控制器中使用特定方法的三种方案：

在实体类中使用自定义方法：

public class Employee 
{
    public int EmployeeId { get; set; }
    public string Name { get; set; }
    public int Age { get; set; }

    public decimal CalculateSalary()
    {
        decimal salary = Age * 1000;
        if (salary < 5000)
            salary = 5000;
        return salary;
    }    
}

在辅助类中使用自定义方法：

public static class EmployeeHelper
{
    public static decimal CalculateSalary(Employee employee)
    {
        decimal salary = employee.Age * 1000;
        if (salary < 5000)
            salary = 5000;
        return salary;
    }
}

在控制器中使用自定义方法：

public class EmployeeController : Controller 
{
    private readonly ApplicationDbContext _context;

    public EmployeeController(ApplicationDbContext context)
    {
        _context = context;
    }

    public IActionResult Index()
    {
        var employees = _context.Employees.ToList();
        var salaries = employees.Select(e => e.CalculateSalary());
        return View(salaries);
    }
}

以上是在实体类、辅助类或控制器中使用特定方法的三种方案。具体实现方法可以根据需求进行调整。